El Departamento de Geología, ha sido organizado con el apoyo de una asistencia externa Alemana. Actualmente cuenta con cuatro Coordinaciones que son: Laboratorio Químico, Laboratorio Mineralógico, Geología Regional y Geología Económica.

El Departamento de Geología desarrolla sus actividades en estrecha coordinación con sus distintas dependencias, como así mismo con los demás departamentos de esta Dirección y su estructura fue organizada dentro del marco de la Cooperación Geológica Paraguayo – Alemana (BGR – DRM) de la siguiente manera:

Coordinación de Geología Regional: En cuanto a Geología Regional se refiere, se cuenta con un mapa geológico oficial del Paraguay, en escala 1:1000.000. A los efectos de suministrar datos geológicos más detallados, se desarrolló un programa propuesto en el marco de la cooperación Geológica Paraguayo – Alemana, que contemplaba cubrir con hojas Geológicas, en escala 1:100.000, abarcando toda la Región Oriental e inclusive la Occidental. Estos trabajos estaban sujetos a la creación de un Servicio Geológico Nacional, a ser implementado en una siguiente etapa; se bien dicho servicio aún no fue creado, los trabajos de mapeamientos han sido elaborados hasta el año 2000, en su versión final, cuatro hojas correspondientes: Hoja Paraguari, San José, Villa Florida y Coronel Oviedo.  Estando en ejecución las hojas de Villarrica y Caacupé. Cave resaltar que la elaboración de estos mapas ha sido posible con apoyo Alemán. La información detallada de la geología contenida en estos mapas, facilitará la ejecución de proyectos futuros en los campos: mineros, agrícolas, urbanísticos, viales, hidrogeológicos entre otros.

Coordinación de Laboratorio Mineralógico:  El Laboratorio Mineralógico cuenta con equipos modernos, ya sea para análisis físicos, mecánicos y mineralógicos.

Para Ensayos Físicos : Se cuenta con un equipo de tamices para determinación granulométrica, como así mismo, la separación de minerales por medio de fluidos con densidades predeterminadas. Además cuenta con equipos de alta precisión, estufas, muflas, etc. Se realizaron 104 quemas para ensayos tecnológicos cerámicos de 800º, 900º, 1000º, 1050º, 1100º, 1150º, 1200º, 1250º y 1300º  Celsius.

 Para Ensayos Mecánicos: Específicamente aplicados a minerales arcillosos para la industria cerámica, se cuenta con elementos de casa grande para la determinación de los límites de Atterberg (plasticidad).

 Para Análisis Petrográficos: Se dispone de una sala de microscopía, para la determinación mineralógica, también la textura y estructura del preparado de roca para su clasificación petrológica. Se cuentan con microscopios polarizantes de alta resolución, equipos modernos de cortadoras y pulidoras especiales para láminas delgadas. 

 Estos ensayos y análisis permiten obtener la información necesaria para el conocimiento y evaluación de los materiales investigados, objeto de los programas que viene desarrollando la Dirección de Recursos Minerales.

Cabe resaltar que la mayor parte de los equipos mencionados han sido implementados dentro del marco de la cooperación Geológica Paraguayo – Alemana.

Coordinación de Laboratorio Químico: El departamento de Geología cuenta así mismo con equipos completos para la determinación mediante ensayos químicos de elementos y compuestos Ej.: SiO₂; P₂O₅; TiO₂; SO₄; NO₃;  N O₂;  N H₄; Cu; Pb; Ag; Ca; Mg; Ni; Fe; Zn; Na; K;  Mn y otros, en arcillas, calcáreos, yesos, minerales metálicos y rocas en general, para lo cual cuenta con equipos modernos tales como espectrómetros de absorción atómica, espectrofotocolorímetro, balanzas analíticas, destiladores, etc. Estos equipos han sido implementados en el marco de la cooperación Geológica Paraguayo – Alemana. Además se debe destacar que con los métodos, equipos y personal adiestrado permiten obtener informaciones en corto plazo, que facilitan desarrollar programas vigentes.

Coordinación de Geología Económica: es la encargada de atender todo lo relacionado con  la ejecución de campañas de prospección geológica  minera, regional o detallada, tendientes  a la localización de minerales, también realiza trabajos de estadísticos de importación y exportación de minerales.